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Heute ist der Herzlöffel in Deutschland extrem vom Aussterben bedroht. Vermutlich gibt es bundesweit nur noch ein einziges Vorkommen im Naturschutzgebiet "Charlottenhofer Weihergebiet" im Landkreis Schwandorf.
Schuld sind wasserbaulichen Maßnahmen und die Entkrautung von Gräben und Kanälen. Auf der anderen Seite wurden insbesondere flache Gewässer oft mit Erde aufgefüllt oder auch entwässert, um Flächen z.B. für die Landwirtschaft nutzbar zu machen.
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