Zusammen mit österreichischen und tschechischen Verbänden, wie dem Naturschutzbund Oberösterreich und Hnuti Duha aus Tschechien, ist der Bund Naturschutz im Dreiländereck Deutschland-Tschechien-Österreich aktiv. 

Die Region Bayerischer Wald / Böhmerwald (Šumava) / Mühlviertel verfügt über ein einmaliges Naturpotential. Insbesondere als Rückzugsraum für seltene, störanfällige Tierarten mit großräumigem Lebensraumanspruch wie z.B. Luchs und Fischotter ist sie von europäischer Bedeutung.

Aufgrund seiner landschaftlichen Attraktivität ist dieser Bereich am Grünen Band Europa jedoch stark durch touristische Projekte, wie den Bau neuer Skianlagen, gefährdet. Die IAG setzt sich grenzüberschreitend für den Erhalt und die nachhaltige, sanfte touristische Nutzung der Region ein.