Zudem sind Abwasserkanäle in vielen deutschen Städten sanierungsbedürftig. Über undichte Stellen gelangen ungeklärte Abwässer direkt ins Erdreich und damit ins Grundwasser.
Ein weiteres Problem sind Arzneimittelrückstände, die aus Krankenhäusern und Privathaushalten in die Kläranlagen gelangen können. Hierzu gehören z.B. künstliche Hormone wie die Anti-Baby-Pille und Psychopharmaka.